Gruppo di Bioinformatica
Istituto Nazionale per la Ricerca sul Cancro
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Dal 1 Settembre 2011 è costituito il nuovo
"IRCCS AZIENDA OSPEDALIERA UNIVERSITARIA SAN MARTINO - IST - ISTITUTO NAZIONALE PER LA RICERCA SUL CANCRO",
ai sensi della Legge Regionale n. 2/2011.
Le informazioni incluse in questo sito sono quindi in corso di aggiornamento.
biowep: a Workflow Enactment Portal for Bioinformatics
Un portale per l'esecuzione di workflow predefiniti. biowep è un software di dominio pubblico, distribuito con la licenza LGPL. Una copia del software può quindi essere prelevata dal sito e installata localmente. Inoltre, è possibile sottoporre workflow realizzati con Taverna. Questi saranno valutati e installati nel portale, se ritenuti di interesse.
L'obiettivo di biowep è quello di rendere disponibili a tutti i ricercatori biomedici attraverso un'interfaccia di semplice utilizzazione, i vantaggi che i "workflow management systems" offrono per l'accesso alle risorse bioinformatiche.
Tramite i workflow è ora possibile automatizzare in maniera flessibile alcune procedure ripetitive che si rendono necessarie per accedere a informazioni e software disponibili in rete su siti diversi.
Il portale da' accesso a una serie di workflow predefiniti che possono essere utilizzati senza conoscere nessun particolare software per lo sviluppo di workflow e nessun sito dove gli strumenti bioinformatici siano messi a disposizione in formato idoneo, normalmente tramite Web Services.
Gli utenti finali possono proporre procedure da automatizzare o sottomettere i propri workflow per l'inclusione nel portale.
Il portale biowep è stato sviluppato nell'ambito del progetto Oncology over Internet ed è in via di potenziamento nell'ambito del progetto LITBIO.
Per maggiori informazioni e chiarimenti, contattate Paolo Romano (paolo.romano@istge.it).
Per raggiungere il portale: http://bioinformatics.istge.it:8080/biowep/
 
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